Лаборатория геномной медицины

       ID ORCID - 0000-0002-3002-2863 

·         h-индекс РИНЦ – 10

·         h-индекс Scopus – 8

·         h-индекс WoS - 8

ГРАНТЫ

1.      Грант РНФ № 21-75-10052 «Молекулярные механизмы развития эндотелиальной дисфункции в ответ на генотоксический стресс». Синицкий М.Ю., Синицкая А.В., Асанов М.А.

2.      Грант Президента РФ для государственной поддержки молодых российских ученых - кандидатов наук №МК-1228.2021.1.4 «Роль генотоксического стресса и повреждения ДНК в формировании эндотелиальной дисфункции: исследование in vitro». Синицкий М.Ю.

ПАТЕНТЫ

1.      Патент № 2753589 C1 Российская Федерация, МПК G01N 33/49. Способ прогнозирования полиорганной недостаточности после операций на сердце, выполненных в условиях искусственного кровообращения : № 2020140540 : заявл. 08.12.2020 : опубл. 18.08.2021 / Е. В. Григорьев, А. В. Понасенко, А. В. Цепокина [и др.] ; заявитель Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Научно-исследовательский институт комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний".

2.      Патент № 2770819 C1 Российская Федерация, МПК A61B 5/00, A61B 8/12, G01N 33/49. Способ определения вероятности наступления госпитального неблагоприятного события после коронарного шунтирования : № 2021123960 : заявл. 10.08.2021 : опубл. 22.04.2022 / Н. А. Безденежных, А. Н. Сумин, О. Л. Барбараш [и др.] ; заявитель Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Научно-исследовательский институт комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний".

3.      Патент № 2770819 C1 Российская Федерация, МПК A61B 5/00, A61B 8/12, G01N 33/49. Способ определения вероятности наступления госпитального неблагоприятного события после коронарного шунтирования : № 2021123960 : заявл. 10.08.2021 : опубл. 22.04.2022 / Н. А. Безденежных, А. Н. Сумин, О. Л. Барбараш, А. В. Безденежных,  А. А. Кузьмина, А. В. Цепокина; заявитель Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Научно-исследовательский институт комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний"

ПУБЛИКАЦИИ

1.      Роль полиморфизма генов, задействованных в атерогенезе, в формировании стабильной ишемической болезни сердца / Понасенко А., Хуторная М., Цепокина А., Синицкий М., Барбараш О. //Kardiologia i Serdechno-Sosudistaya Khirurgia. – 2022. – Т. 15. – №. 3. – С. 221-227. – DOI 10.17116/kardio202215031221

2.      Изменение уровней мРНК генов ДНК-метилтрансфераз в эндотелиальных клетках, обработанных митомицином / Синицкий М. Ю., Синицкая А. В., Шишкова Д. К. [и др.] // Молекулярная биология. – 2022. – Т. 56. – № 3. – С. 491-497. – DOI 10.31857/S0026898422030156

3.      Immune Response and Lipid Metabolism Gene Polymorphisms Are Associated with the Risk of Obesity in Middle-Aged and Elderly Patients / Ponasenko A., Sinitsky M., Khutornaya M. [et al.] // Journal of Personalized Medicine. – 2022. – Vol. 12. – No 2. – P. 238. – DOI 10.3390/jpm12020238

4.      Изменение экспрессии генов в створках нативных клапанов сердца, пораженных инфекционным эндокардитом / Синицкая А. В., Синицкий М. Ю., Хуторная М. В. [и др.] // Сибирский журнал клинической и экспериментальной медицины. – 2022. – Т. 37. – № 2. – С. 98-104. – DOI 10.29001/2073-8552-2022-37-2-98-104

5.      Уровень оксидативного стресса в эндотелиальных клетках, культивируемых в присутствии митомицина С / Синицкий М. Ю., Синицкая А. В., Шишкова Д. К., Асанов М. А., Хуторная М. В., Понасенко А. В. //Сибирский журнал клинической и экспериментальной медицины. – 2022. – Т. 37. – №. 3. – С. 121-127. - DOI 10.29001/2073-8552-2022-37-3-121-127

6.      Identification of Key Genes and Pathways in Genotoxic Stress Induced Endothelial Dysfunction: Results of Whole Transcriptome Sequencing / Sinitsky M., Sinitskaya A., Shishkova D., Tupikin A., Asanov M., Khutornaya M., Ponasenko A. //Biomedicines. – 2022. – Т. 10. – №. 9. – С. 2067. DOI 10.3390/biomedicines10092067

7.      Генетические предикторы спорадических врожденных пороков сердца у детей / Шабалдин А. В., Цепокина А. В., Шмулевич С. А., Понасенко А. В. // Молекулярная медицина. – 2022. – Т. 20. – № 1. – С. 53-58. – DOI 10.29296/24999490-2022-01-09

8.      Роль полиморфизма генов фолатного цикла у матерей: вклад в предрасположенность к развитию врожденных пороков сердца / Шабалдин А. В., Синицкая А. В., Шмулевич С. А., Понасенко А. В. // Проблемы репродукции. – 2022. – Т. 28. – № 5. – С. 23-28. – DOI 10.17116/repro20222805123

9.      Tackling Atherosclerosis via Selected Nutrition / Vesnina A. D., Prosekov A. Yu., Atuchin V. V., Ponasenko A.V. // International Journal of Molecular Sciences. – 2022. – Vol. 23. – No 15. – P. 8233. – DOI 10.3390/ijms23158233

10.  Сравнение бактериальной флоры, выделенной из периферической крови и клапанных структур сердца пациентов с инфекционным эндокардитом / Асанов М. А., Казачек Я. В., Евтушенко А. В. [и др.] // Acta Biomedica Scientifica (East Siberian Biomedical Journal). – 2022. – Т. 7. – № 2. – С. 91-98. – DOI 10.29413/ABS.2022-7.2.10

11.  Роль генов цитокинов и Toll-подобных рецепторов в патогенезе врожденных пороков сердца / Шабалдин А. В., Синицкая А. В., Шмулевич С. А. // Медицинская иммунология. – 2022. – Т. 24. – № 3. – С. 605-616. – DOI 10.15789/1563-0625-ROC-2488

12.  Патофизиологические подходы к изучению дисфункции эндотелия и методологические аспекты определения ее критериев в контексте моделирования гистогематического барьера / Кутихин А. Г., Шишкова Д. К., Великанова Е. А., Синицкий М. Ю. [и др.] // Российский физиологический журнал им. И.М. Сеченова. – 2022. – Т. 108. – № 5. – С. 594-625. – DOI 10.31857/S0869813922050077

13.  Оценка паракринных эффектов кондиционированной среды в ходе ее перекрестного добавления при моделировании взаимодействий в морфофункциональной системе “кондуит–артерия” / Фролов А. В., Шишкова Д. К., Маркова В. Е., Синицкий М. Ю., Синицкая А. В. [и др.] // Российский физиологический журнал им. И.М. Сеченова. – 2022. – Т. 108. – № 8. – С. 940-956. – DOI 10.31857/S0869813922080039

14.  Early Postoperative Immunothrombosis of Bioprosthetic Mitral Valve and Left Atrium: A Case Report / Kostyunin A., Glushkova T., Stasev A., Sinitskaya A., Asanov M. [et al.] // International Journal of Molecular Sciences. – 2022. – Vol. 23. – No 12. – DOI 10.3390/ijms23126736

15.  Оценка возможности использования колониеформирующих эндотелиальных клеток для разработки тканеинженерных сосудистых графтов на основании анализа профиля генной экспрессии / Великанова Е. А., Синицкий М. Ю., Синицкая А. В. [и др.] // Современные технологии в медицине. – 2022. – Т. 14. – № 3. – С. 15-21. – DOI 10.17691/stm2022.14.3.02

16.  Анализ факторов риска формирования дефицита здоровья и его индикаторных показателей у детей с врожденными пороками сердца через два года после радикальной операции / Игишева Л. Н., Румянцева А. А., Шабалдин А. В., Синицкая А. В. [и др.] // Анализ риска здоровью. – 2022. – № 2. – С. 151-165. – DOI 10.21668/health.risk/2022.2.14

17.  Analysis of risk factors causing health deficiency and its indicators in children with congenital heart diseases two years after radical surgery / Igisheva L. N., Rumyantseva A. A., Shabaldin A. V., Sinitskaya A.V. [et al.] // Health Risk Analysis. – 2022. – No 2. – P. 151-165. – DOI 10.21668/health.risk/2022.2.14.eng

 ПРОЕКТЫ

Изучение механизмов развития течения инфекционного эндокардита заключается в комплексной оценке всех патогенетических путей. В одном из наших исследований получены данные, демонстрирующие пролонгированный локальный иммунный ответ, выражающийся в неспецифическом повышении экспрессии генов, а также белков провоспалительных цитокинов при подостром течении инфекционного эндокардита в нативных створках клапанов сердца даже после направленной антибактериальной терапии наблюдается.

Выделены четыре группы генов, оценённых по характеру изменения их экспрессии в створках клапанов сердца пациентов с ИЭ: гены с повышенной экспрессией (IL1B, IL6 и IL8); гены с пониженной экспрессией (IL33 и IL1RL1); гены, экспрессия которых значимо не изменялась (IL12A, IL18, IL23 и CCL2) и гены, экспрессия которых в изученных образцах не обнаружена (IL10 и IL12B). Протеомное профилирование позволило идентифицировать пять молекул с повышенным (MIF, PAI1, IL16, IL6 и IL8) и одну молекулу (CXCL12) со сниженным содержанием в тканях, по сравнению с контролем. Также мы установили наличие различий в уровнях экспрессии маркеров оксидативного стресса в образцах нативных клапанов сердца, собранных от пациентов с инфекционным эндокардитом и при приобретенных пороках неинфекционной этиологии. Показано, что определяемые методом количественной ПЦР уровни мРНК PXDN1, SOD1 и CAT, а также NOS3 и EDN значимо ниже, чем в створках контроля. Так же, при иммунофлуоресцентном окрашивания антителами к нитротирозину определили, что в створках нативных клапанов имеются различия по уровню экспрессии этого маркера NO-зависимого оксидативного стресса. Так, в створке клапана, пораженного ИЭ, отмечено низкий уровень свечения (1) по сравнению с образцами клапанов контроля.

При изучении маркеров осложнений раннего послеоперационного протезирования клапанов сердца продемонстрировано наличие дискоординации иммунного ответа у лиц с подострым течением инфекционного эндокардита еще на дооперационном этапе протезирования клапанов сердца, что имеет клиническое выражение в развитии ранних послеоперационных осложнений хирургического лечения клапанного порока. Наибольшее прогностическое значение для оценки риска развития полиорганной недостаточности в раннем послеоперационном периоде протезирования имеют низкие значения концентраций IgМ и IgG, при параллельном определении высоких концентраций циркулирующих иммунных комплексов, содержащих С3d компонент комплемента и высокие концентрации С5а компонента комплемента. Клиническая апробация полученных в результате исследования данных подтвердила эффективность использования данных маркеров при оценке риска развития осложнений в раннем послеоперационном периоде протезирования клапанов сердца у пациентов с подострым инфекционным эндокардитом. 

 Отдел экспериментальной медицины