Лаборатория геномной медицины

Научная деятельность сотрудников лаборатории геномной медицины посвящена изучению причинно-следственных связей наследственных и приобретенных сердечно-сосудистых заболевания и коморбидной патологии с мутациями генома человека и их связь с окружающей средой.

В лаборатории разрабатываются новые диагностические тесты для выявления различного вида рисков для индивидуальной профилактической медицины и новые подходы к лечению болезней сердечно-сосудистого континуума.

Научные задачи лаборатории:  

 -Изучить роль генетической предрасположенности в патофизиологических механизмах развития атеросклероза и сопутствующих ему заболеваний;

 -Определить степень участия механизмов клеточного старения в патогенезе болезней сердечно-сосудистого континуума;

 -Оценить значение полиморфизма генов различных патогенетических путей при формировании приобретенных пороков сердца;

 -Установить генетически-детерминированные механизмы, обуславливающие реципиент- обусловленные дисфункции биологических протезов клапанов сердца;

 -Моделирование In vitro ответа клеточного генома на мутагенное воздействие и введение фармакологических препаратов;

 -Поиск молекулярно-генетических маркеров развития осложнений в раннем и отдаленном периоде после хирургической коррекции сердечно-сосудистой патологии.

       ID ORCID - 0000-0002-3002-2863 

·         h-индекс РИНЦ – 11

·         h-индекс Scopus – 8

·         h-индекс WoS - 8

ГРАНТЫ

1.      Грант РНФ № 21-75-10052 «Молекулярные механизмы развития эндотелиальной дисфункции в ответ на генотоксический стресс». Синицкий М.Ю., Синицкая А.В., Асанов М.А.

2.      Грант Президента РФ для государственной поддержки молодых российских ученых - кандидатов наук №МК-1228.2021.1.4 «Роль генотоксического стресса и повреждения ДНК в формировании эндотелиальной дисфункции: исследование in vitro». Синицкий М.Ю.

ПАТЕНТЫ

1.      Патент № 2753589 C1 Российская Федерация, МПК G01N 33/49. Способ прогнозирования полиорганной недостаточности после операций на сердце, выполненных в условиях искусственного кровообращения : № 2020140540 : заявл. 08.12.2020 : опубл. 18.08.2021 / Е. В. Григорьев, А. В. Понасенко, А. В. Цепокина [и др.] ; заявитель Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Научно-исследовательский институт комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний".

2.      Патент № 2770819 C1 Российская Федерация, МПК A61B 5/00, A61B 8/12, G01N 33/49. Способ определения вероятности наступления госпитального неблагоприятного события после коронарного шунтирования : № 2021123960 : заявл. 10.08.2021 : опубл. 22.04.2022 / Н. А. Безденежных, А. Н. Сумин, О. Л. Барбараш [и др.] ; заявитель Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Научно-исследовательский институт комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний".

3.      Патент № 2770819 C1 Российская Федерация, МПК A61B 5/00, A61B 8/12, G01N 33/49. Способ определения вероятности наступления госпитального неблагоприятного события после коронарного шунтирования : № 2021123960 : заявл. 10.08.2021 : опубл. 22.04.2022 / Н. А. Безденежных, А. Н. Сумин, О. Л. Барбараш, А. В. Безденежных,  А. А. Кузьмина, А. В. Цепокина; заявитель Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Научно-исследовательский институт комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний"

 ПРОЕКТЫ

Изучение механизмов развития течения инфекционного эндокардита заключается в комплексной оценке всех патогенетических путей. В одном из наших исследований получены данные, демонстрирующие пролонгированный локальный иммунный ответ, выражающийся в неспецифическом повышении экспрессии генов, а также белков провоспалительных цитокинов при подостром течении инфекционного эндокардита в нативных створках клапанов сердца даже после направленной антибактериальной терапии наблюдается.

Выделены четыре группы генов, оценённых по характеру изменения их экспрессии в створках клапанов сердца пациентов с ИЭ: гены с повышенной экспрессией (IL1B, IL6 и IL8); гены с пониженной экспрессией (IL33 и IL1RL1); гены, экспрессия которых значимо не изменялась (IL12A, IL18, IL23 и CCL2) и гены, экспрессия которых в изученных образцах не обнаружена (IL10 и IL12B). Протеомное профилирование позволило идентифицировать пять молекул с повышенным (MIF, PAI1, IL16, IL6 и IL8) и одну молекулу (CXCL12) со сниженным содержанием в тканях, по сравнению с контролем. Также мы установили наличие различий в уровнях экспрессии маркеров оксидативного стресса в образцах нативных клапанов сердца, собранных от пациентов с инфекционным эндокардитом и при приобретенных пороках неинфекционной этиологии. Показано, что определяемые методом количественной ПЦР уровни мРНК PXDN1, SOD1 и CAT, а также NOS3 и EDN значимо ниже, чем в створках контроля. Так же, при иммунофлуоресцентном окрашивания антителами к нитротирозину определили, что в створках нативных клапанов имеются различия по уровню экспрессии этого маркера NO-зависимого оксидативного стресса. Так, в створке клапана, пораженного ИЭ, отмечено низкий уровень свечения (1) по сравнению с образцами клапанов контроля.

При изучении маркеров осложнений раннего послеоперационного протезирования клапанов сердца продемонстрировано наличие дискоординации иммунного ответа у лиц с подострым течением инфекционного эндокардита еще на дооперационном этапе протезирования клапанов сердца, что имеет клиническое выражение в развитии ранних послеоперационных осложнений хирургического лечения клапанного порока. Наибольшее прогностическое значение для оценки риска развития полиорганной недостаточности в раннем послеоперационном периоде протезирования имеют низкие значения концентраций IgМ и IgG, при параллельном определении высоких концентраций циркулирующих иммунных комплексов, содержащих С3d компонент комплемента и высокие концентрации С5а компонента комплемента. Клиническая апробация полученных в результате исследования данных подтвердила эффективность использования данных маркеров при оценке риска развития осложнений в раннем послеоперационном периоде протезирования клапанов сердца у пациентов с подострым инфекционным эндокардитом. 

Отдел экспериментальной медицины