Отдел экспериментальной медицины

Действующая фундаментальная тема:

Молекулярные, клеточные и биомеханические механизмы патогенеза сердечно-сосудистых заболеваний в разработке новых методов лечения заболеваний сердечно-сосудистой системы на основе персонифицированной фармакотерапии, внедрения малоинвазивных медицинских изделий, биоматериалов и тканеинженерных имплантатов

Научные направления отдела:

1. Патогенетическое обоснование, разработка, клиническая апробация и оценка результатов применения новых протезов и трансплантатов для замещения пораженных элементов сердечно-сосудистой системы;
2. Разработка новых методов лечения с использованием клеточных и нанотехнологий;
3. Обоснование вклада генетических и иммунологических факторов в развитие атеросклероза и формирование заболеваний сердечно-сосудистой системы;
4. Освоение и развитие достижений современной фундаментальной биомедицинской науки и внедрение их в исследовательскую практику Института.

 Научные задачи отдела:

1. Патогенетическое обоснование разработки новых биосовместимых материалов на основе нанотехнологий и тканевой инженерии для сердечно-сосудистой хирургии;
2. Клиническая апробация, оценка ранних и отдалённых результатов применения новых моделей кардиоваскулярных биопротезов;
3. Выявление генетических предикторов формирования сердечно-сосудистых заболеваний и патологических состояний, осложняющих их течение;
4. Освоение и внедрение в исследовательскую практику Института современных методов визуализации ультраструктуры тканей;
5. Оказание помощи клиническим подразделениям Института при выполнении экспериментов in vivo и in vitro;
6. Трансляция научно обоснованных технологий диагностики и лечения в практическую клиническую деятельность института.

ID ORCID - 0000-0002-6134-7468

·         h-индекс РИНЦ – 12

·         h-индекс Scopus – 10

·         h-индекс WoS - 6

ГРАНТЫ

1.      Грант РНФ № 20-15-00075 «Разработка биодеградируемого сосудистого протеза малого диаметра с атромбогенным и противомикробным покрытием» под руководством академика РАН Л.С. Барбараша

2.       Грант Российского Научного Фонда «Проведение исследований научными группами под руководством молодых ученых» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными № 21-75-10128 «Транскатетерный полимерный протез митрального клапана генеративного дизайна на основе машинного обучения» (2021-2024 гг.)

3.      Грант Российского Научного Фонда «Проведение исследований научными группами под руководством молодых ученых» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными № 18-75-10061 «Исследование и реализация концепции роботизированного малоинвазивного протезирования клапана аорты» (2018-2021 гг.).

4.      Грант Совета по грантам Президента Российской Федерации для государственной поддержки молодых российских ученых и по государственной поддержке ведущих научных школ Российской Федерации № МК-1891.2020.7 «Метод персонализированной реконструкции фиброзного кольца клапана сердца при ишемической митральной регургитации» (2020-2021 гг.).

5.       Грант РНФ № 19-15-00032 «Молекулярные механизмы токсичности кальций-фосфатных бионов для эндотелия», 2019-2021 (руководитель, проект продолжается).

6.      Грант РФФИ № 19-015-00198 «Изучение взаимодействий между эндотелиальными клетками коронарной и внутренней грудной артерии с целью патогенетического обоснования эффективности применения аутоартериальных кондуитов для коронарного шунтирования», 2019-2021.

7.      Грант Google Kaggle (Open Data Research Grant) «Dissecting the Plaque: Defining a Culprit of Stroke by Image Analysis» (Расшифровывая атеросклеротическую бляшку: выявление причин инсульта при помощи анализа изображений), 2020.

ПАТЕНТЫ

1. Патент № 2642259 Рос. Федерация. Функционально Тканеинженерный биодеградируемый сосудистый имплант / Антонова Л.В., Кудрявцева Ю.А., Барбараш Л.С., Барбараш О.Л.; заявитель и правообладатель Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Науч.-исслед. ин-т комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний» - №2016123645; заявл. 14.06.2016;  зарегистр. 24.01.2018– 1с.

2. Патент № 2675269 Рос. Федерация. Функционально Способ изготовления биодеградируемого сосудистого графта с модифицированной поверхностью / Антонова Л.В., Сильников В.Н., Королева Л.С., Кудрявцева Ю.А., Миронов А.В., Барбараш Л.С., Барбараш О.Л.; заявитель и правообладатель Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Науч.-исслед. ин-т комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний» - № 2018105259; заявл. 12.02.2018;  зарегистр. 18.12.2018– 1с.

3. Патент № 2702239 Рос. Федерация. Технология изготовления функционально активных биодеградируемых сосудистых протезов малого диаметра с лекарственным покрытием / Антонова Л.В., Резвовой М.А., Севостьянова В.В., Кудрявцева Ю.А., Барбараш О.Л., Барбараш Л.С. ; заявитель и правообладатель Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Науч.-исслед. ин-т комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний» - №2019119912;заявл. 25.06.2019;  зарегистр. 7.10.2019 – 1с.

4. Патент № 2707964 Рос. Федерация. Функционально активная биодеградируемая сосудистая заплата для артериальной реконструкции / Антонова Л. В., Миронов А. В., Королева Л. С., Севостьянова В.В., Барбараш О. Л., Барбараш Л. С ; заявитель и правообладатель Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Науч.-исслед. ин-т комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний» - №2019115006 ;заявл. 15.05.2019;  зарегистр. 03.12. 2019   – 1с.

5. Патент № 187483 Рос. Федерация. Протез клапана сердца для малоинвазивной бесшовной имплантации / Барбараш Л.С., Овчаренко Е.А., Клышников К.Ю., Щеглова Н.А. Кудрявцева Ю.А.; заявитель и правообладатель Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Науч.-исслед. ин-т комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний» - №2018125778 ; заявл. 12.07.18 ;  зарегистр. 06.03.2019 – 1с.

6. Патент № 2725917 Рос. Федерация. Способ численного моделирования транскатетерной имплантации клапана сердца пациента / Ганюков В.И.. Кочергин Н.А.,  Верещагин И.Е., Овчаренко Е.А., Клышников К.Ю.; заявитель и правообладатель Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Науч.-исслед. ин-т комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний»  - № 2019128550; заявл.  11.09.2019;  зарегистр. 07.07.2020.  – 1с.

7. Патент № 2731317 Рос. Федерация. Биологический сосудистый протез с усиливающим внешним каркасом / Барбараш О.Л., Овчаренко Е.А., Резвова М.А., Клышников К.Ю.; заявитель и правообладатель Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Науч.-исслед. ин-т комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний»  - № 2019119911; заявл.  25.06.2019;  зарегистр. 01.09.2020  – 1с.

8. Патент № 196245 Рос. Федерация. Баллонный катетер имплантационный / Клышников К.Ю., Овчаренко Е.А. Барбараш Л.С.; заявитель и правообладатель Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Науч.-исслед. ин-т комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний»  - № 2019127149; заявл.  27.08.2019;  зарегистр. 21.02.2020.  – 1с.

9. Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ № 2020616525  Рос. Федерация.  Пациент-специфическая адаптация геометрии кольца-протеза для аннулопластики, основанная на данных трехмерной эхокардиографии/ Онищенко П.С., Овчаренко Е.А., Клышников К.Ю.; заявитель и правообладатель Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Науч.-исслед. ин-т комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний» - № 2020614872; заявл.  15.05.2020;  зарегистр. 18.06.2020.  – 1с.

10. Патент № 206723Рос. Федерация Персонифицированное кольцо-протез митрального клапана с переменной жесткостью / Овчаренко Е.А., Клышников К.Ю., Стасев А.Н., Резвова М.А.; заявитель и правообладатель Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Науч.-исслед. ин-т комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний». - № 2021102936; заявл. 08.02.2021; зарегистр.  23.09.2021.  – 1с.

11. Патент № 2758260 Рос. Федерация Способ изготовления аутологичного фибрина с регулируемым содержанием фибриногена без использования экзогенного тромбина / Матвеева В.Г., Антонова Л.В., Ханова М.Ю., Барбараш О.Л., Барбараш Л.С.; заявитель и правообладатель Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Науч.-исслед. ин-т комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний». - № 2020143003; заявл. 24.12.2020; зарегистр. 27.10.2021.  – 1с.

12. Патент № 2764051 Рос. Федерация.: МПК A61F 2/06, A61L 27/14, A61L 27/34, C12N 5/00 Способ изготовления in vitro персонифицированного клеточнозаселенного сосудистого протеза / Матвеева В.Г., Антонова Л.В., Ханова М.Ю., Барбараш О.Л., Барбараш Л.С., Великанова Е. А., Севостьянова В.В.; заявитель и правообладатель Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Науч.-исслед. ин-т комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний» (RU). - № 2021112402; заявл. 28.04.2021; зарегистр. опубл. 13.01.2022, Бюл. № 2. – 1с.

ПУБЛИКАЦИИ

1.    Kostyunin A, Glushkova T, Velikanova E, Mukhamadiyarov R, Bogdanov L, Akentyeva T, Ovcharenko E, Evtushenko A, Shishkova D, Markova Y, Kutikhin A. Embedding and Backscattered Scanning Electron Microscopy (EM-BSEM) Is Preferential over Immunophenotyping in Relation to Bioprosthetic Heart Valves.
Int J Mol Sci. 2023;24(17):13602. doi: 10.3390/ijms241713602.

2.    Gruzdeva O, Dyleva Y, Belik E, Uchasova E, Ponasenko A, Ivanov S, Zinets M, Stasev A, Kutikhin A, Markova V, Poddubnyak A, Gorbatovskaya E, Fanaskova E, Barbarash O. Expression of Ceramide-Metabolizing Enzymes in the Heart Adipose Tissue of Cardiovascular Disease Patients. Int J Mol Sci. 2023;24(11):9494. doi: 10.3390/ijms24119494.

3.    Antonova LV, Sevostianova VV, Silnikov VN, Krivkina EO, Velikanova EA, Mironov AV, Shabaev AR, Senokosova EA, Khanova MY, Glushkova TV, Akentieva TN, Sinitskaya AV, Markova VE, Shishkova DK, Lobov AA, Repkin EA, Stepanov AD, Kutikhin AG, Barbarash LS. Comparison of the Patency and Regenerative Potential of Biodegradable Vascular Prostheses of Different Polymer Compositions in an Ovine Model. Int J Mol Sci. 2023;24(10):8540. doi: 10.3390/ijms24108540.

4.    Sinitsky M, Asanov M, Sinitskaya A, Shishkova D, Khutornaya M, Minina V, Ponasenko A. Atorvastatin Can Modulate DNA Damage Repair in Endothelial Cells Exposed to Mitomycin C. Int J Mol Sci. 2023;24(7):6783. doi: 10.3390/ijms24076783.

5.    Rezvova MA, Klyshnikov KY, Gritskevich AA, Ovcharenko EA. Polymeric Heart Valves Will Displace Mechanical and Tissue Heart Valves: A New Era for the Medical Devices. Int J Mol Sci. 2023;24(4):3963. doi: 10.3390/ijms24043963.

6.    Markova V, Bogdanov L, Velikanova E, Kanonykina A, Frolov A, Shishkova D, Lazebnaya A, Kutikhin A. Endothelial Cell Markers Are Inferior to Vascular Smooth Muscle Cells Markers in Staining Vasa Vasorum and Are Non-Specific for Distinct Endothelial Cell Lineages in Clinical Samples. Int J Mol Sci. 2023;24(3):1959. doi: 10.3390/ijms24031959.

7.    Kostyunin AE, Glushkova TV, Lobov AA, Ovcharenko EA, Zainullina BR, Bogdanov LA, Shishkova DK, Markova VE, Asanov MA, Mukhamadiyarov RA, Velikanova EA, Akentyeva TN, Rezvova MA, Stasev AN, Evtushenko AV, Barbarash LS, Kutikhin AG. Proteolytic Degradation Is a Major Contributor to Bioprosthetic Heart Valve Failure. J Am Heart Assoc. 2023;12(1):e028215. doi: 10.1161/JAHA.122.028215.

8.    Antonova L, Kutikhin A, Sevostianova V, Lobov A, Repkin E, Krivkina E, Velikanova E, Mironov A, Mukhamadiyarov R, Senokosova E, Khanova M, Shishkova D, Markova V, Barbarash L. Controlled and Synchronised Vascular Regeneration upon the Implantation of Iloprost- and Cationic Amphiphilic Drugs-Conjugated Tissue-Engineered Vascular Grafts into the Ovine Carotid Artery: A Proteomics-Empowered Study. Polymers (Basel). 2022;14(23):5149. doi: 10.3390/polym14235149.

9.    Shishkova D, Lobov A, Zainullina B, Matveeva V, Markova V, Sinitskaya A, Velikanova E, Sinitsky M, Kanonykina A, Dyleva Y, Kutikhin A. Calciprotein Particles Cause Physiologically Significant Pro-Inflammatory Response in Endothelial Cells and Systemic Circulation. Int J Mol Sci. 2022;23(23):14941. doi: 10.3390/ijms232314941.

10. Bogdanov L, Shishkova D, Mukhamadiyarov R, Velikanova E, Tsepokina A, Terekhov A, Koshelev V, Kanonykina A, Shabaev A, Frolov A, Zagorodnikov N, Kutikhin A. Excessive Adventitial and Perivascular Vascularisation Correlates with Vascular Inflammation and Intimal Hyperplasia. Int J Mol Sci. 2022;23(20):12156. doi: 10.3390/ijms232012156.

11. Gruzdeva OV, Dyleva YA, Belik EV, Sinitsky MY, Kozyrin KA, Barbarash OL. Characteristics of adipocytokine expression by local fat depots of the heart: Relationship with the main risk factors for cardio-vascular diseases. Front Endocrinol (Lausanne). 2022;13:991902. doi: 10.3389/fendo.2022.991902.

12. Sinitsky M, Sinitskaya A, Shishkova D, Tupikin A, Asanov M, Khutornaya M, Kabilov M, Ponasenko A. Identification of Key Genes and Pathways in Genotoxic Stress Induced Endothelial Dysfunction: Results of Whole Transcriptome Sequencing. Biomedicines. 2022;10(9):2067. doi: 10.3390/biomedicines10092067.

13. Kostyunin A, Glushkova T, Stasev A, Mukhamadiyarov R, Velikanova E, Bogdanov L, Sinitskaya A, Asanov M, Ovcharenko E, Barbarash L, Kutikhin A. Early Postoperative Immunothrombosis of Bioprosthetic Mitral Valve and Left Atrium: A Case Report. Int J Mol Sci. 2022;23(12):6736. doi: 10.3390/ijms23126736.

14. Matveeva VG, Senokosova EA, Sevostianova VV, Khanova MY, Glushkova TV, Akentieva TN, Antonova LV, Barbarash LS. Advantages of Fibrin Polymerization Method without the Use of Exogenous Thrombin for Vascular Tissue Engineering Applications. Biomedicines. 2022;10(4):789. doi: 10.3390/biomedicines10040789.

15. Rezvova MA, Nikishau PA, Makarevich MI, Glushkova TV, Klyshnikov KY, Akentieva TN, Efimova OS, Nikitin AP, Malysheva VY, Matveeva VG, Senokosova EA, Khanova MY, Danilov VV, Russakov DM, Ismagilov ZR, Kostjuk SV, Ovcharenko EA. Biomaterials Based on Carbon Nanotube Nanocomposites of Poly(styrene-b-isobutylene-b-styrene): The Effect of Nanotube Content on the Mechanical Properties, Biocompatibility and Hemocompatibility. Nanomaterials (Basel). 2022;12(5):733. doi: 10.3390/nano12050733.

16. Gruzdeva OV, Dyleva YA, Belik EV, Sinitsky MY, Stasev AN, Kokov AN, Brel NK, Krivkina EO, Bychkova EE, Tarasov RS, Barbarash OL. Relationship between Epicardial and Coronary Adipose Tissue and the Expression of Adiponectin, Leptin, and Interleukin 6 in Patients with Coronary Artery Disease. J Pers Med. 2022;12(2):129. doi: 10.3390/jpm12020129.

17. Shishkova DK, Velikanova EA, Bogdanov LA, Sinitsky MY, Kostyunin AE, Tsepokina AV, Gruzdeva OV, Mironov AV, Mukhamadiyarov RA, Glushkova TV, Krivkina EO, Matveeva VG, Hryachkova ON, Markova VE, Dyleva YA, Belik EV, Frolov AV, Shabaev AR, Efimova OS, Popova AN, Malysheva VY, Kolmykov RP, Sevostyanov OG, Russakov DM, Dolganyuk VF, Gutakovsky AK, Zhivodkov YA, Kozhukhov AS, Brusina EB, Ismagilov ZR, Barbarash OL, Yuzhalin AE, Kutikhin AG. Calciprotein Particles Link Disturbed Mineral Homeostasis with Cardiovascular Disease by Causing Endothelial Dysfunction and Vascular Inflammation. Int J Mol Sci. 2021;22(22):12458. doi: 10.3390/ijms222212458.

18. Mukhamadiyarov RA, Bogdanov LA, Glushkova TV, Shishkova DK, Kostyunin AE, Koshelev VA, Shabaev AR, Frolov AV, Stasev AN, Lyapin AA, Kutikhin AG. EMbedding and Backscattered Scanning Electron Microscopy: A Detailed Protocol for the Whole-Specimen, High-Resolution Analysis of Cardiovascular Tissues. Front Cardiovasc Med. 2021;8:739549. doi: 10.3389/fcvm.2021.739549.

19. Antonova LV, Krivkina EO, Sevostianova VV, Mironov AV, Rezvova MA, Shabaev AR, Tkachenko VO, Krutitskiy SS, Khanova MY, Sergeeva TY, Matveeva VG, Glushkova TV, Kutikhin AG, Mukhamadiyarov RA, Deeva NS, Akentieva TN, Sinitsky MY, Velikanova EA, Barbarash LS. Tissue-Engineered Carotid Artery Interposition Grafts Demonstrate High Primary Patency and Promote Vascular Tissue Regeneration in the Ovine Model. Polymers (Basel). 2021;13(16):2637. doi: 10.3390/polym13162637.

20. Antonova L, Kutikhin A, Sevostianova V, Velikanova E, Matveeva V, Glushkova T, Mironov A, Krivkina E, Shabaev A, Senokosova E, Barbarash L. bFGF and SDF-1α Improve In Vivo Performance of VEGF-Incorporating Small-Diameter Vascular Grafts. Pharmaceuticals (Basel). 2021;14(4):302. doi: 10.3390/ph14040302.

21. Gruzdeva OV, Belik EV, Dyleva YA, Borodkina DA, Sinitsky MY, Naumov DY, Bychkova EE, Fanaskova EV, Palicheva EI, Kuzmina AA, Karetnikova VN, Barbarash OL. Expression of adipocytokines in heart fat depots depending on the degree of coronary artery atherosclerosis in patients with coronary artery disease. PLoS One. 2021;16(3):e0248716. doi: 10.1371/journal.pone.0248716.

22. Shishkova D, Markova V, Sinitsky M, Tsepokina A, Velikanova E, Bogdanov L, Glushkova T, Kutikhin A. Calciprotein Particles Cause Endothelial Dysfunction under Flow. Int J Mol Sci. 2020;21(22):8802. doi: 10.3390/ijms21228802.

23. Sinitsky MY, Kutikhin AG, Tsepokina AV, Shishkova DK, Asanov MA, Yuzhalin AE, Minina VI, Ponasenko AV. Mitomycin C induced genotoxic stress in endothelial cells is associated with differential expression of proinflammatory cytokines. Mutat Res Genet Toxicol Environ Mutagen. 2020;858-860:503252. doi: 10.1016/j.mrgentox.2020.503252.

24. Shishkova D, Markova V, Sinitsky M, Tsepokina A, Frolov A, Zagorodnikov N, Bogdanov L, Kutikhin A. Co-Culture of Primary Human Coronary Artery and Internal Thoracic Artery Endothelial Cells Results in Mutually Beneficial Paracrine Interactions. Int J Mol Sci. 2020;21(21):8032. doi: 10.3390/ijms21218032.

25. Kostyunin A, Mukhamadiyarov R, Glushkova T, Bogdanov L, Shishkova D, Osyaev N, Ovcharenko E, Kutikhin A. Ultrastructural Pathology of Atherosclerosis, Calcific Aortic Valve Disease, and Bioprosthetic Heart Valve Degeneration: Commonalities and Differences. Int J Mol Sci. 2020;21(20):7434. doi: 10.3390/ijms21207434.

В составе отдела 4 научных лаборатории:

Лаборатория новых биоматериалов

Лаборатория геномной медицины

Лаборатория клеточных технологий

Лаборатория исследований гомеостаза